Для физ товаров актуален вывод остатка, хотя бы в панели админстратора (управлении заказами и товарами).
Для покупателя, при оформлении отсутствующего товара, например выводит сообщение о предзаказе.
В настройках панели сделать вывод для покупателя опционным по чекбоксу " Выодить сообщение о предзаказе"